kg_alpha возвращена, но кодирует роль узла: сущности 255 (непрозрачны), наблюдения 150. Диапазон NODE_TRANSPARENCY в Cytoscape — 0–255, а не проценты (прежние 100 = 39% непрозрачности, отсюда общее побледнение). Константы ALPHA_ENTITY/ALPHA_OBSERVATION в colors.mjs; колонка, маппинг и запись в sync восстановлены. 96 тестов.