Раньше наблюдение брало цвет родителя как есть: у чёрных проектов
квадраты становились чёрными и сливались с крупными кругами в сплошное
пятно. Теперь заливка — приглушённый оттенок (подмешивание белого,
tint в конфиге, по умолчанию 0.6): принадлежность к кластеру видна, но
форма графа не перебивается.

Чистые функции tintColor/observationFill в config.mjs; build и sync
считают заливку через них. Прозрачный родитель (file) и отсутствие
родителя дают нейтральный цвет.

Попутно зафиксирован открытый дефект: --update/--watch не удаляют узлы,
исчезнувшие из памяти (issue в памяти, пункт в ROADMAP).